Compare “Não envie agora” e “Não, envie agora” em uma conversa.

Uma forma de resolver
A primeira pede para adiar o envio. A segunda pode negar uma sugestão anterior e depois pedir o envio imediato. O contexto completa a interpretação.
O que precisa continuar valendo
A vírgula organiza relações sintáticas e sentidos. Não é simplesmente a indicação de uma pausa respiratória; seu uso depende da construção do enunciado.
A pontuação participa do sentido e exige atenção à intenção comunicativa.
Separar sujeito e verbo com vírgula, sem elemento intercalado que justifique a pontuação, rompe uma relação básica: “Os alunos, chegaram” é inadequado nesse contexto.
Agora mude o contexto
Compare “Não espere” e “Não, espere”. O sentido é o mesmo?
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Não. A primeira frase pede que a pessoa não espere. Na segunda, a negativa pode responder a uma fala anterior e o pedido seguinte é esperar.
Retome a ideia em um caso mais direto
Em “Depois da aula, Ana revisou o caderno”, o trecho inicial indica tempo. Em “Ana, revise o caderno”, Ana é um vocativo, separado por vírgula.
Pontue o chamamento em “Pedro entregue os livros”.
Conferir a resposta comentada
“Pedro, entregue os livros.” Pedro é a pessoa a quem o pedido se dirige, ou seja, um vocativo.
Uma pista para levar consigo
Vírgulas podem delimitar expressões que funcionam como comentários ou explicações. Teste se retirar o segmento intercalado conserva uma oração completa. Em casos de restrição, a pontuação pode mudar quais pessoas ou objetos estão sendo mencionados.
Mais um caso para testar a ideia
Como isolar a descrição em “Rui o zelador da escola abriu o portão”?
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“Rui, o zelador da escola, abriu o portão.” Duas vírgulas delimitam a explicação intercalada. Retire-a e a relação entre Rui e abriu continua íntegra.
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